尿道炎主要以抗菌药物治疗为主。如果是淋菌性尿道炎主要是以青霉素类抗生素为主，如头炮曲松、大观霉素等。病情较轻的患者可以选择口服喹诺酮类的抗生素;病情较重的患者可选择静脉滴注。

非淋菌性尿道炎常用的药物有喹诺酮类、大环内酯或四环素类药物。口服药物应在医生的指导下服用，，避免自行甲减药物剂量。服药期间避免喝酒，吃辛辣刺激的食物。